要想明白这个问题，首先就要知道，社保机构为什么要在办理退休时查询个人档案？
原因有两个，一是要看你的档案里是否有视同缴费年限，符合国家规定的连续工龄可视同养老保险缴费年限，这个影响着你的养老金待遇计算；
二是确定你的退休年龄，因为按照规定，当本人身份证与档案记载的出生时不一致时，以本人档案最先记载的出生时间为准。
明白了这个，就可以知道，个人档案无论存放在哪里，都不影响你缴纳社保，因为缴纳社保不需要提交个人档案。
而个人档案是否影响办理退休，就要看你档案里是否有工龄也就是视同缴费年限的记载，这一般是对于在社保制度建立之前的老人来说的，如果有视同缴费年限的记载，那么档案就会影响你的退休待遇。
对于社保建立之后参保的新人来说，社保机构会根据你的实际缴费年限等因素计算养老金，而档案里一般都没有视同缴费年限的记载，所以个人档案一般只是例行审阅，并无实质影响。
